面對氣候變遷的挑戰，保種重要性不言可喻，但卻面臨經費、資源不足窘境，研究人員擔心，若我國不積極進行，未來我們的餐桌食物，恐受制於他國。
農試所作物種原組研究員兼組長溫英杰表示，各國採種團隊都深入各地採集種子，美國到緬甸帶回抗病蟲害的品種，此外，大陸在非洲、韓國在緬甸、日本在印尼蓋種原中心，一方面支助小國，同時蒐集種子。日本更曾來台灣採集連台灣人都不知道的武陵野梅原生種原。
溫英杰說，保種育種都是百年大計，現在不做，未來就來不及，如果有新的品種，還能夠跟其他國家交流、拿到更新的種原。不過近年來，官方跟社會不重視，使研究經費不斷縮減。農試所所長陳駿季表示，有保種才有育種，雖然大家都知道保種的重要性，可是需要經費時「又是另一回事」。
台大農藝系名譽教授郭華仁表示，農委會研究經費十年來逐年減少，但育種需要長期投資，一個品種至少要培育八到十年，可惜社會對於農業發展看得不夠長遠，立法院要求農業改良機構等研究單位每年也都要有「業績」，扭曲農業研究本質，使得育種家只好迎合市場需求，培育容易技轉的種子。
立委蔡培慧說，目前總體預算忽略品種改良，農試所早期育種目標都是「肥美量多」，如今應考量培育耐極端氣候品種的目標。
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